經過不到一週的休息，2016年F1第17站來到了日本鈴鹿賽車場，過去曾於富士賽道輪流舉辦F1賽事的鈴鹿賽道，自2009年富士賽道退出後便固定舉辦至今。有著獨特的8字型設計，成為了賽事中唯一並行順時針與逆時針方向的賽道，超過40m的高低落差，不僅考驗車手技術，也提升賽事可看性。總長5.807km，賽事需要於此進行53圈，賽程總長達307.471km。相同於馬來西亞站，輪胎供應商也於本站提供橘胎、白胎與黃胎供選擇。
於週六的排位賽中，MERCEDES AMG PETRONAS車隊Nico Rosberg順利的以1:30.647單圈成績取得桿位，這也是Nico Rosberg連續三年於此站奪得桿位，而隊友Lewis Hamilton則以1:30.660些微秒差居次。除了第一排發車的MERCEDES AMG PETRONAS車隊以外，第二排則由Scuderia Ferrari兩車手取得，但由於兩位車手分別因上一站碰撞與本站更換動力單元的原因，皆受到賽會判罰退位，因此剛好由原本處第三排出發位置的Red Bull Racing兩車手遞補。
週日的正賽，Lewis Hamilton的起跑失利讓場上排名順序大洗牌，但在賽事僅出現一次黃旗的狀況下順利結束，場上22位車手皆順利完賽，締造F1歷史上第七場所有參加車手順利完賽的賽事紀錄。
不同於Nico Rosberg相當順利的起跑與一路保持領先的態勢，隊友Lewis Hamilton起跑失利後位置一下子從第二名掉到了第八名位置，但也老套的利用車輛動力優勢上演追擊戲碼，加上充分運用換胎潮的策略，讓Lewis Hamilton爬升速度相當快，於第15圈時就已追趕到第四名的位置，到最後剩下10圈時更與當時排名第二、Red Bull Racing車隊的Max Verstappen展開精彩的近距離駁火對戰。受到前方慢車影響，讓Lewis Hamilton擁有多次追近甚至超越Max Verstappen的機會，但在Max Verstappen超齡的卓越換線防守動作中Lewis Hamilton功虧一簣，最後以保有原本順序的姿態通過終點線，Nico Rosberg奪冠、Max Verstappen亞軍，而Lewis Hamilton則為季軍。
與隊友兩個席次的差距，讓Nico Rosberg於日本站結束後以313分的積分，在車手積分排行榜中以33分的差距拉大與隊友Lewis Hamilton間的距離，不過在雙雄激烈的競爭中，最大得利者自然是兩者所屬車隊MERCEDES AMGPETRONAS，以593分的積分大幅領先第二名Red Bull Racing車隊的385分，讓賽事還剩下四站的狀態中提前於本站結束後封王。接下來，就是MERCEDES AMG PETRONAS車隊的雙雄之爭，在車隊公開表示開放兩者公平競爭的狀態下，兩週後的美國站肯定相當有看頭！
